Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clstn2Q9ER65 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Clstn2Q9ER65 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clstn2Q9ER65 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms