Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rapgef4Q9EQZ6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms