Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnn1Q9EQR3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnn1Q9EQR3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnn1Q9EQR3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnn1Q9EQR3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnn1Q9EQR3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnn1Q9EQR3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnn1Q9EQR3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnn1Q9EQR3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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