Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr6Q9EQ16 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr6Q9EQ16 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr6Q9EQ16 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr6Q9EQ16 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr6Q9EQ16 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms