Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ropn1lQ9EQ00 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ropn1lQ9EQ00 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms