Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r54Q9EPB8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vmn1r54Q9EPB8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r54Q9EPB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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