Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syde1Q9DBZ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syde1Q9DBZ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms