Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtr1Q9DBC3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtr1Q9DBC3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtr1Q9DBC3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtr1Q9DBC3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtr1Q9DBC3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtr1Q9DBC3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtr1Q9DBC3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtr1Q9DBC3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms