Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem239Q9DA47 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem239Q9DA47 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms