Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd9Q9D9M4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdzd9Q9D9M4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd9Q9D9M4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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