Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actrt1Q9D9J3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Actrt1Q9D9J3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms