Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl4Q9D8E6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl4Q9D8E6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl4Q9D8E6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms