Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms