Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp5Q9D7S9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp5Q9D7S9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp5Q9D7S9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms