Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
2310002L09RikQ9D7L5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
2310002L09RikQ9D7L5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms