Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Borcs8Q9D6Y4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs8Q9D6Y4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms