Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm5Q9D6G9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm5Q9D6G9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms