Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PudpQ9D5U5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PudpQ9D5U5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms