Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sf3a3Q9D554 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sf3a3Q9D554 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms