Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc130Q9D516 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc130Q9D516 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms