Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf6Q9D4J7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf6Q9D4J7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf6Q9D4J7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf6Q9D4J7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf6Q9D4J7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf6Q9D4J7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf6Q9D4J7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf6Q9D4J7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf6Q9D4J7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf6Q9D4J7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf6Q9D4J7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms