Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubgcp4Q9D4F8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubgcp4Q9D4F8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubgcp4Q9D4F8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubgcp4Q9D4F8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubgcp4Q9D4F8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubgcp4Q9D4F8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubgcp4Q9D4F8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms