Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rsph14Q9D3W1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rsph14Q9D3W1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsph14Q9D3W1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms