Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag1Q9D3E6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms