Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt44Q9D2Q2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt44Q9D2Q2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt44Q9D2Q2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt44Q9D2Q2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt44Q9D2Q2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt44Q9D2Q2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trmt44Q9D2Q2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms