Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc6bQ9D289 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc6bQ9D289 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms