Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl28Q9D1B9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms