Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hddc3Q9D114 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Hddc3Q9D114 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Hddc3Q9D114 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hddc3Q9D114 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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