Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pbdc1Q9D0B6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms