Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nde1Q9CZA6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms