Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
3100002H09RikQ9CXW6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
3100002H09RikQ9CXW6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
3100002H09RikQ9CXW6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
3100002H09RikQ9CXW6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
3100002H09RikQ9CXW6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms