Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tmem50aQ9CXL1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tmem50aQ9CXL1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem50aQ9CXL1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms