Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nip7Q9CXK8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nip7Q9CXK8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nip7Q9CXK8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms