Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Utp23Q9CX11 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp23Q9CX11 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.7 ms