Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RpainQ9CWY9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RpainQ9CWY9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms