Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cxxc1Q9CWW7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxxc1Q9CWW7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms