Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snw1Q9CSN1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms