Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ1

Hsbp1, Heat shock factor-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsbp1Q9CQZ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hsbp1Q9CQZ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hsbp1Q9CQZ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms