Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifitm3Q9CQW9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifitm3Q9CQW9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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