Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rer1Q9CQU3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rer1Q9CQU3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms