Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim8Q9CQQ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim8Q9CQQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms