Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nicn1Q9CQM0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nicn1Q9CQM0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nicn1Q9CQM0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nicn1Q9CQM0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Nicn1Q9CQM0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms