Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tmed6Q9CQG0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tmed6Q9CQG0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tmed6Q9CQG0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Tmed6Q9CQG0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tmed6Q9CQG0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmed6Q9CQG0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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