Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl11Q9CQF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl11Q9CQF0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl11Q9CQF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms