Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTRAFQ9CQE8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms