Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd1Q9CQA6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Chchd1Q9CQA6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Chchd1Q9CQA6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chchd1Q9CQA6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms