Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb3bpQ9CQ82 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3bpQ9CQ82 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3bpQ9CQ82 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3bpQ9CQ82 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb3bpQ9CQ82 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb3bpQ9CQ82 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms