Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Use1Q9CQ56 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Use1Q9CQ56 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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