Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp3Q9CQ10 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp3Q9CQ10 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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