Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntnap2Q9CPW0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap2Q9CPW0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms